癫痫发作会对大脑造成损害，发作时，呼吸暂停易造成脑组织低氧水肿、功能损害，大脑神经细胞的高频放电直接对脑造成损害，久而久之易导致患者记忆力减退，智能降低，引起记忆障碍、智力下降、性格改变，又可促使发作次数增多。
一些症状性癫痫常伴有智力低下，甚至不乏智障者。一些病史较长的患者常出现行为怪异，如少言寡语、性格孤僻、易冲动暴怒、多疑等。部分患者癫痫发作会影响到呼吸、血压、脉搏等，对其他组织器官造成伤害。
特别是癫痫发作时患者意识丧失会造成身体摔伤，肢体抽搐会导致擦伤碰伤，精神异常又会引发自伤伤人。这些都严重影响患者的生活、工作和学习，有些危害可能一时不易觉察，但病程越长影响越明显。
